PDF User Manual

  1. Home
  2. Manuals
  3. Park Systems XE-100 User Manual

Park Systems XE-100 User Manual

Made by: Park Systems
Type: User Manual
Category: Microscope
Pages: 10
Size: 0.39 MB


Download PDF User Manual

Full Text Searchable PDF User Manual

background image

Park XE-100 AFM User Manual 

Ed Fei and Ryan Brock 

Updated 10/30/13




This document is intended as a quick reference for basic operation of the 

Park XE-100 and is by no means a comprehensive manual.  It is strongly suggested 
that users look through the Park documentation.  The better you understand the 
instrument, the more effectively you will be able to use it. 

This device is highly 

similar to the Park XE-70. Differences have been highlighted in green.


Basic AFM Principles 

When the tip is suspended in air, the laser will hit the center of the quadrant photodetector. 
If the tip encounters a feature on the surface, the tip deflects and the laser will move on the 
quadrant photodetector.  This is relayed to a motor controlling the tip which adjusts the tip’s 
vertical position until the laser is aimed in the center of the quadrant photodetector once again.  
Effectively, this keeps the tip at a constant distance from the sample surface.  By recording the 
position of the motor height, we can now know the topography of the sample surface.  
The tips provided in this lab are intended for ‘non-contact’ AFM, which is similar in principle to 
what is described above. Rather than relying on physical contact with the surface, the 
cantilever/tip is oscillated at a given frequency above the sample surface, and interactive forces 
from the surface lead to changes in the amplitude/phase of this oscillation.  
Setting up the AFM is simple: adjust the mirrors until the light path follows the diagram below 




background image

Login To Badger, Enable Device 
Hardware Setup


1) Unplug head and remove it by pulling flaps towards you and sliding head out to the right. 
Never handle head from bottom to ensure safety of the AFM tip. 

2) Mount sample on stage


3) Mount a new tip if one is not already mounted.  If using your own tips, CAREFULLY remove 
the existing tip and place it in the ‘good’ tips box. Ensure new tip is rested in place and that 
bearings fit into tip slots. 

4) Replace head and push flaps away from you until slightly tight.  This secures the head 
position. Plug head in. 

5) Check that SPM Controller and Monitors are On (should already be on) 

6) Turn on Light Bank, 

Isolation stage

, and Laser (via “Laser Switch”). LEDs on head indicate 

general location of laser on photodetector. 

7) Open ‘XEC’ program, click on Open USB Camera (icon in top left corner).  





Laser switch 



background image

Aim Laser on End of Cantilever (Adjust Mirror 1)  


Open ‘XEP’ program, press OK if frequency sweep window opens. 

On the XE-100, the 

optical microscope position (‘Focus Stage’) is controlled through the software similarly to how 
the Z-stage position is controlled. When ‘Focus Follow’ is selected, the Focus Stage will match 
any movements made by the Z-stage – useful for keeping the cantilever in focus.




Find and focus on cantilever

:  If you don’t see the cantilever right away, first check that the 

Focus Stage

 is at the proper height to see the cantilever and check that enough light is coming 

from the light bank.  If you still don’t see the cantilever, you will need to adjust the position of 
the microscope (knobs located above head on microscope column).  Look at where the light from 
the microscope is shining on the tip assembly, as this will help you to center the microscope. 

Position laser on cantilever: 

If you don’t see the laser reflected off the cantilever (and the laser 

is on), use the ‘Mirror 1’ knobs to move the laser along the vertical axis until you see it reflected 
on the edge of the probe, then move horizontally as needed.  Tightening the vertical position 
knob will raise the laser, loosening it will lower it. Aim the laser near the end of the cantilever 
(example above), where the deflection will be the greatest.   
NOTE: Make sure that you position the 


 beam spot - you may also see a 



spot that will be dimmer.  To make sure you are aiming the primary beam spot on the end of the 
cantilever, move the laser to the base of the cantilever then loosen the vertical position knob.  
This will lower the laser position to the end of the cantilever. 

Mirror 2 

Mirror 1 


background image

Aim Laser on Center of Photodetector (Adjust Mirror 2) 


XEP software should already be open.


2) Check (A+B) voltage value (measures total intensity of light hitting the photodetector), which 
should be ~3-3.5 V if using ACTA tips provided by the lab. 

- The correct value will be different if you use your own tips.   

- If the (A+B) sum is significantly less than 3V, this indicates that either the ‘mirror 2’ 
alignment is way off, or the laser spot on the cantilever may actually be the reflected spot 
as mentioned above.  Adjust the ‘mirror 2’ knobs, first turning one knob until you find a 
local maximum of (A+B) voltage, then turning the other knob until you find the local 
maximum again.  Repeat as needed until the sum is at the appropriate value.   

- If after several tries, you still can’t get the sum high enough, remove the head and check 
mirror 2’s position visually – it should be roughly parallel to the base. Adjust mirror 2 
knobs as needed and then replace head 

3) Adjust ‘Mirror 2’ knobs to position laser spot on center of photodetector, reducing the (A-B) 
and (C-D) voltages to less than +/-0.3V. The XEP software will indicate the position of the laser 
as a red dot once it is reasonably near the center of the photodetector.  

Option A: Adjust the knobs while watching the laser position in the software and turning 
in the correct direction to move toward the center of the diagram/minimize the (A-B) and 
(C-D) voltages. 

Option B: Use the diagram below as a guide for which knob to turn and in which 
direction depending upon where the laser is shining.   




T = tighten 
L = loosen 

T1, L2 

L1, L2 





T2, T1 




Mirror 2 Knobs 



background image

Mode, Scanner, and Frequency Selection 

1) Turn off Head in software 
2) Click on Parts Select 
3) Select proper mode of operation and scanner ranges 

Head Mode: NC-AFM - 

ACTA tips should only be used for NC-AFM (non-contact mode)


XY Voltage Mode: High (50um x 50um) or Low (5umx5um) 
Z Voltage Mode: High (12 um) or Low (1.7 um) 
Z Scanner Range: Set to 1.00  
Cantilever: General 

4) Click OK 

5) Turn Head back on in software, Frequency Sweep Window will open. 

6) The software will automatically detect the cantilever’s resonance peak and select a driving 
frequency just above that peak.  

- If a very weak peak appears (peak is on the order of the noise) or if there is strong non-
ideal behavior like a double peak, replace the tip.  An additional indication of a bad 
cantilever is a Drive % at/near 100. This is a rare occurrence under normal operation. 

7) Click OK 



Bad (low amplitude, 100% drive)                        Good 



background image

Initial Surface Approach 

1) Ensure sample is under the tip by adjusting the x/y stage controls. 

2) Using Z-stage control window (with Focus Follow enabled), approach surface to within a few 
mm.  Only go as far as you feel comfortable that the tip is still well away from surface. 

3) Using Focus Stage control window, focus on sample. 

4) Move sample to desired area using x/y stage controls 

5) Move the Focus Stage up ~50-100 um above sample surface. 


Turn Focus Follow off.

 Use the Z-stage control window to lower tip until it comes into focus. 

7) Refocus the microscope on sample surface using Focus Stage. 

When sample is in focus, image 

of tip should be slightly blurry.


8) Check laser position to ensure A-B and C-D are still less than +/- 0.3 V 

9) Shut acoustic enclosure 

10) Click Approach button in Z-stage control 

- When the approach stops, the “light” in the Z-stage Control window will stop blinking.  

- Ensure that the Z-scanner bar is half green.  This indicates that the system is tracking 
the surface.   

Z-scanner troubleshooting

: If the Z-scanner bar is all white, the system did not find 

the surface (and will actually move UP, not down, if the ‘Approach’ button is pressed).  

1) Raise the Z-stage a small amount (just until the tip becomes blurry in the 
optical microscope and the topography trace goes flat) 

2) Z-scanner will turn green 

2a) If the Z-scanner bar does not turn green after you have retracted the tip, 
open the frequency sweep window (icon at right) and hit the Refresh button. 

3) Increase the Drive % by 5% (e.g. 10% to 15%, not 10% to 10.5%) 

4) Approach again.  Repeat until the system is able to engage the sample. 



background image

Optimize Scan Parameters 

1) Click on Input configuration icon 


2) Select channels of interest, show at least trace and retrace of topography 

3) Change the scan size to appropriate value (5µm or 50µm max depending on XY scanner) 

A good image is achieved when trace and retrace show the same topography and are stable 
(repeatedly show the same topography and there are no random spikes or other instabilities).  
Trace and retrace may not overlap perfectly but if the shapes of the curves are identical, then the 
image will generally be good. To improve the tracking, adjust the following: 


Z-servo gain

 - Increasing the gain will help the tip track the sample better.  However, if the 

gain is too high, you will see high-frequency noise.  Increase/decrease the gain until the best 
image is obtained.  In most cases, the optimal value will be from 1-5. 


Scan rate - 

Decrease the scan rate to 0.5 Hz or 0.25 Hz.  This effectively reduces the speed at 

which the tip moves, allowing the system more time to adjust to sudden changes in height.  Be 
careful, as this will also proportionately increase the time needed to take images. 


Set Point - 

Adjusting the Set Point up/down will change the distance the tip hovers above the 

sample surface when scanning and can improve resolution of features/surface tracking. This can 
be done manually by changing the number in the ‘Set Point’ box or by adjusting the red bar in 
the frequency sweep window.  


Drive % - 

Adjust the Drive% by a few tenths of a percent at a time to see if your image 

quality improves. This will increase the force with which the tip oscillates.  Only adjust this 
setting after exhausting the other options as increasing the drive can deteriorate the tip life. 




Getting a good image can take time.

  It is a matter of iterating between adjusting the gain, set 

point and drive. If you are unable to get a good image, there are three additional options:   

1) Hit the “NCM ASetup” button at the bottom of the scan parameters window.  This will run an 
automatic routine to try and find a good set of scan parameters.  The frequency window will 
open automatically.  Hit OK to close this window.  

2) If you still don’t see your surface, retract the tip from the sample, increase the initial drive %, 
and re-approach the sample. 

3) If you still don’t see your surface, it may be that the tip you are using is damaged.  Raise the 
optical microscope, then raise the Z-stage well away from your surface.  Remove the head.  Put 
the tip in the ‘Bad Probes” box and select a new probe from the ‘Good Probes’ box. 


background image

Collect Image 

1) Click on Scan Parameters icon to select image resolution (128x128, 256x256, etc).   

1a) You may need to adjust the scan parameters slightly after making a change. 

2) Click Start button under Image label. 

3) Once complete, double click on the color bars next to the images.  This will flatten the image. 

You can send the image to the Scan Area Control by right clicking on the image, and hit “Send 
to Scan Area Control”.  Click on the ‘Scan Area’ tab at the bottom of the scan control window.  
This will allow you to shift your next scan area relative to the image you just collected, and 
automatically adjusts the software settings to the appropriate scan size, x/y offsets, and rotation. 
To take an image in a different region of the sample, disengage from surface using the Z-stage 
control, adjust position with the x/y stage controls, and repeat the surface approach procedure. 

Modify with XEI 

You can send images directly to the XEI data analysis software from the ‘Buffer’ in XEP by 
right clicking on them.  Or you can open them from the ‘spmdata’ or ‘User Files’ folders. 

Flattening your sample: 

To flatten your sample, go to the flatten area button.  Select all the areas that are supposed to be 
flat and on the same height.  Exclude any non-flat features (e.g. mesas, trenches etc) that will 
distort the flattening routine. Select the line routine (1


 order regression).  Select x-axis if your 

scan was done in the x-axis, y-axis if your scan was done in the y-axis.  Click “Execute”.  Save 
your flattened image (preferably as a separate file). 
You can also try using the line, whole, and difference routines.  Read more about the different 
flattening algorithms in the XEI manual. 
Another useful feature is the ability to save the numerical data from any image, graph, or table as 
a .txt file by right clicking on the image/graph/table. 
Save file to ‘User Files’ folder.  

Include .tiff extension in filename

Screenshots can also be exported as jpg, png, of bmp files by selecting Export from the File 


background image

Shut down 








“Lift Z” 

right away.


The stage will hit the microscope on the way up and 

damage one or both of them. Use Z-stage control to lift tip away from sample a small distance so 
the tip is no longer touching the sample.   

2) Open the acoustic enclosure 

3) Enable Focus Follow and then hit ‘Lift Z’ button in Z-stage control. Both the microscope and 
Z-stage will raise. 

4) Refocus microscope on cantilever as needed.


5) Turn off laser switch, unplug head, and remove head. 

5a) If the tip you used was good, leave it on the AFM. Otherwise, remove head and place tip in 
the “Bad Probes” box 

6) Remove sample from stage and replace head, plug head in. 

7) Close XEP/XEI/XEC software 

8) Turn off Light Bank  

9) Leave the SPM Controller on 


**Log tip usage, clean up after yourself, and disable in Badger** 











Note: We recycle used sample pucks and also used tips.  Please put used items in the proper 
places.  Do not throw them in the trash. 


If you notice any problems while running the instrument, please make a comment on Badger and 
email the lab managers at nano-spmstaff@lists.stanford.edu. 


background image

XE-100 AFM Order of Operations 




Turn on system, mount tip if needed 



Turn on XEC/XEP software 



Focus microscope on cantilever 



Position laser spot on end of cantilever 



Position laser reflection on center of photodetector (A+B ~3.5V, A-B and C-D ~0.3V) 



Select appropriate mode, scanner, and frequency 



Approach surface 



Get optically close (several mm) 



Focus microscope ~50-100um from surface, move Z-stage til cantilever in focus 



Click ‘Approach’ 



Adjust scan parameters (Z servo gain, scan rate, set point, drive) 



Collect images 



Send to XEI to process/save 



Follow shutdown procedure